自然界分离出一个新菌株怎么确定一个菌株是新种

来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/05/13 16:18:45
自然界分离出一个新菌株怎么确定一个菌株是新种

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自然界分离出一个新菌株怎么确定一个菌株是新种
第一步,扩增16s序列,比对数据库已定种的序列,一般相似度低于97.5%视为疑似新种.
第二步,获得16s全长序列,构建系统发育树.
第三步,根据系统发育树选择对比的若干标准菌株.
第四步,结合标准菌株的定种文献,测定限制因子、生理生化、形态学、遗传学分析等各类指标,并与标准菌株比较,如有足够多的不同之处,以此可以判定为新种.
该过程称为多相分类学研究.

应该需要基因工具吧....

16S rDNA测序,某些保守序列测序,在NCBI上比对确定属。
与属内的每个种的标准菌株进行DNA杂交,杂交率小于70%,还有测复性温度
全细胞可溶性蛋白SDS—PAGE,碳源使用,氮源使用,酶图谱
很多东西。。。。

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